杂草是农业生产中的一大生物灾害，它和作物争夺养分，是病虫的中间寄主，并且生命力顽强传播能力强屡灭不绝，成为农业生产中的重要灾害，比如小麦中的黑麦草。所以在生产中开始大量使用除草剂，结果却是污染了环境。
在有机农业的生产理念中，杂草除了有危害的一面，还有可以利用的一面，比如保护土壤，显示生产环境的变化，休闲土地并且可以成为绿肥，同时可以提高农田的生物多样性，成为天敌的栖息地。
有机农业中采用非化学方法清除田间杂草，消除杂草种子的传播。具体技术有以下几种：
1.清除杂草种子，有机肥要腐熟，种子要纯净
2.先促进田地的杂草生长，然后翻耕田地，再进行播种
3.采用田间覆盖，减少杂草的光合作用，抑制杂草生长
4.提前直播，使作物早于杂草生长，加大生产密度以减少杂草的生长空间
5.适时人工锄草
6.田间实行合理的轮作和间套作，抑制某种杂草成为优势杂草
7.放养一些食草生物，进行生物防治
8.采用天然的生物性的除草剂，防治杂草
9.建立隔离带，防止生产区外的杂草种子的传播，尤其是放牧和引进的有机肥是杂草传播的重要途径。
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