在农作物侵染性病害中，主要有真菌性病害和细菌性病害两种，其中真菌性病害约占病害的80％。由于真菌性病害和细菌性病害的病源不同，其防治方法和药剂使用也截然不同。所以，正确诊断区别两种病害，是防治这两种病害的关键。其诊断依据主要是两种病害的病症特点：
一、真菌性病害
1．根肿菌属和粉痂菌属。多引发细胞膨大分裂，使受害部位呈根肿或瘿瘤。
2．霜霉属和盘梗霉属真菌。多引发霜霉病，腐生和弱寄生菌，使作物的花、果实、块根、块茎等储藏器官的组织坏死。
3．子囊菌亚门真菌中的白粉菌。在寄主的叶片下面呈白色或灰色的霉层，布满整个叶片，后期散生黑色小点。
4．担子菌亚门中的黑粉菌和锈菌。可诱发黑粉病和锈病。
5．半知菌亚门的真菌。引发寄主发生性的组织坏死，其中无孢子目病原真菌，主要侵害根部和茎基部，造成根腐和茎基腐。
6．芽孢纲病原真菌。以侵害作物的疏导组织为主，造成全株系统发病，如枯萎病，黄萎病等。
7．腔孢菌纲的黑盘孢菌。其表现症状为常见的炭疽病，病斑为同心轮纹排列的小黑点，有的还分泌粉红色或白色的黏液。
8．球壳菌目的真菌。引起的病状类型较多：斑点型的，主要危害叶片；溃疡型的，主要危害茎、枝条；腐烂型的，被害部位形成干腐或湿腐。
由于真菌性病害的类型、种类繁多，引起的病害症状也千变万化。但是，凡属真菌性病害，无论发生在什么部位，症状表现如何，在潮湿的条件下都有菌丝、孢子产生。这是判断真菌性病害的主要依据。
二、细菌性病害
细菌性病害主要表现为：坏死与腐烂，萎蔫与畸形。坏死、腐烂与畸形，都是细菌破了薄细胞壁细胞组织所导致的后果。在其网状叶脉的叶片上，病斑呈多角斑，病斑周围有黄色的晕环。在肥厚组织或果实上的病斑，多为圆形。在柔嫩肉、多汁的组织上，组织死亡易生腐烂。有的部位被害后发生促进性病变，形成肿瘤，这种现象多发生在根或茎上。萎蔫是细胞侵染维管束的结果，可局部或全部发生。维管束细胞被破坏后，水分、营养物质不能正常输送，会造成植株萎蔫死亡。细胞性病害没有菌丝、孢子，病斑表面没有霉状物，但有菌脓(除根癌病菌)溢出，病斑表面光滑，这是诊断细菌性病害的主要依据。
以上所述是诊断这两种病害的主要区别标志，要认真仔细的区别判断；正确选择药剂进行防治，尽可能降低这两种病害的危害程度。
